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module load orca/4.0 | <nowiki>module load orca/4.0</nowiki> | ||
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############### USER VARS ############# | <nowiki>############### USER VARS #############</nowiki> | ||
export TMPDIR=/scratch | <nowiki>export TMPDIR=/scratch</nowiki> | ||
DIRECTORY=$PWD | <nowiki>DIRECTORY=$PWD</nowiki> | ||
SCRIPT=tightorcaoptb3lypd3CO | <nowiki>SCRIPT=tightorcaoptb3lypd3CO</nowiki> | ||
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############ PREEXECUTION ############# | <nowiki>############ PREEXECUTION #############</nowiki> | ||
mkdir $TMPDIR/$JOB_NAME.$JOB_ID | <nowiki>mkdir $TMPDIR/$JOB_NAME.$JOB_ID</nowiki> | ||
cd $TMPDIR/$JOB_NAME.$JOB_ID | <nowiki>cd $TMPDIR/$JOB_NAME.$JOB_ID</nowiki> | ||
cp $DIRECTORY/$SCRIPT.in ./ | <nowiki>cp $DIRECTORY/$SCRIPT.in ./</nowiki> | ||
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Latest revision as of 14:05, 15 October 2018
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############## SGE VARS ############# #!/bin/bash
#$ -N tightorcaoptb3lypd3CO
#$ -cwd
#$ -pe c12m128gpu8_smp 12
#$ -m ae
#$ -M mbesora@iciq.cat #$ -r n
#$ -masterq c12m128gpu8.q
#$ -o $JOB_NAME.o$JOB_ID #$ -e $JOB_NAME.e$JOB_ID
#$ -l credits=0
#$ -S /bin/bash
#######################################
############### APP VARS #############
. /etc/profile.d/modules.sh
module load orca/4.0
#######################################
############### USER VARS #############
export TMPDIR=/scratch
DIRECTORY=$PWD
SCRIPT=tightorcaoptb3lypd3CO
#######################################
############ PREEXECUTION #############
mkdir $TMPDIR/$JOB_NAME.$JOB_ID
cd $TMPDIR/$JOB_NAME.$JOB_ID
cp $DIRECTORY/$SCRIPT.in ./
####################################### ########### EXEC ##########
time $ORCA_HOME/orca tightorcaoptb3lypd3CO.in > tightorcaoptb3lypd3CO.out
cp -f *.out $DIRECTORY/.