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<nowiki> | <nowiki> | ||
####################################### | ####################################### | ||
############## SGE VARS ############# | ############## SGE VARS ############# | ||
#!/bin/bash | #!/bin/bash | ||
#$ -N tightorcaoptb3lypd3CO | #$ -N tightorcaoptb3lypd3CO | ||
#$ -cwd | #$ -cwd | ||
#$ -pe c12m128gpu8_smp 12 | #$ -pe c12m128gpu8_smp 12 | ||
#$ -m ae | #$ -m ae | ||
#$ -M mbesora@iciq.cat | #$ -M mbesora@iciq.cat | ||
#$ -r n | #$ -r n | ||
#$ -masterq c12m128gpu8.q | #$ -masterq c12m128gpu8.q | ||
#$ -o $JOB_NAME.o$JOB_ID | #$ -o $JOB_NAME.o$JOB_ID | ||
#$ -e $JOB_NAME.e$JOB_ID | #$ -e $JOB_NAME.e$JOB_ID | ||
#$ -l credits=0 | #$ -l credits=0 | ||
#$ -S /bin/bash | #$ -S /bin/bash | ||
####################################### | ####################################### | ||
############### APP VARS ############# | ############### APP VARS ############# | ||
. /etc/profile.d/modules.sh | . /etc/profile.d/modules.sh | ||
module load orca/4.0 | module load orca/4.0 | ||
####################################### | ####################################### | ||
############### USER VARS ############# | ############### USER VARS ############# | ||
export TMPDIR=/scratch | export TMPDIR=/scratch | ||
DIRECTORY=$PWD | DIRECTORY=$PWD | ||
SCRIPT=tightorcaoptb3lypd3CO | SCRIPT=tightorcaoptb3lypd3CO | ||
####################################### | ####################################### | ||
############ PREEXECUTION ############# | ############ PREEXECUTION ############# | ||
mkdir $TMPDIR/$JOB_NAME.$JOB_ID | mkdir $TMPDIR/$JOB_NAME.$JOB_ID | ||
cd $TMPDIR/$JOB_NAME.$JOB_ID | cd $TMPDIR/$JOB_NAME.$JOB_ID | ||
cp $DIRECTORY/$SCRIPT.in ./ | cp $DIRECTORY/$SCRIPT.in ./ | ||
####################################### | ####################################### | ||
########### EXEC ########## | ########### EXEC ########## | ||
time $ORCA_HOME/orca tightorcaoptb3lypd3CO.in > tightorcaoptb3lypd3CO.out | time $ORCA_HOME/orca tightorcaoptb3lypd3CO.in > tightorcaoptb3lypd3CO.out | ||
cp -f *.out $DIRECTORY/. | cp -f *.out $DIRECTORY/. | ||
</nowiki> | </nowiki> | ||
Revision as of 14:01, 15 October 2018
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####################################### ############## SGE VARS ############# #!/bin/bash #$ -N tightorcaoptb3lypd3CO #$ -cwd #$ -pe c12m128gpu8_smp 12 #$ -m ae #$ -M mbesora@iciq.cat #$ -r n #$ -masterq c12m128gpu8.q #$ -o $JOB_NAME.o$JOB_ID #$ -e $JOB_NAME.e$JOB_ID #$ -l credits=0 #$ -S /bin/bash ####################################### ############### APP VARS ############# . /etc/profile.d/modules.sh module load orca/4.0 ####################################### ############### USER VARS ############# export TMPDIR=/scratch DIRECTORY=$PWD SCRIPT=tightorcaoptb3lypd3CO ####################################### ############ PREEXECUTION ############# mkdir $TMPDIR/$JOB_NAME.$JOB_ID cd $TMPDIR/$JOB_NAME.$JOB_ID cp $DIRECTORY/$SCRIPT.in ./ ####################################### ########### EXEC ########## time $ORCA_HOME/orca tightorcaoptb3lypd3CO.in > tightorcaoptb3lypd3CO.out cp -f *.out $DIRECTORY/.