Tips for running xtb calculations

QUEUES FOR XTB CALCULATIONS

The available queues for XTB 6.2.3 are:

c36m128 
c28m128
c24m128
c20m48
c12m24
cq4m4

EXAMPLE SUBMIT SCRIPT

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############## SGE VARS ###############
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#!/bin/bash
#$ -N jobname
#$ -cwd
#$ -pe c24m128_smp 24
#$ -m ae
#$ -masterq c24m128.q
#$ -o $JOB_NAME.o$JOB_ID
#$ -e $JOB_NAME.e$JOB_ID
#$ -S /bin/bash
#$ -l credits=5

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############### APP VARS ##############
#######################################
. /etc/profile.d/modules.sh
module load xtb/6.2.3

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############### USER VARS #############
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export MKL_NUM_THREADS=24
export OMP_THREAD_LIMIT=24
export OMP_NUM_THREADS=${OMP_THREAD_LIMIT},1
export OMP_STACKSIZE=3626m

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############ PREEXECUTION #############
#######################################

ulimit -s unlimited

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########### USER VARS & EXEC ##########

echo "\$symmetry" >> command.inp
echo "maxat=0" >> command.inp
echo "\$end" >> command.inp
time xtb jobname.xyz --gbsa ch2cl2 --ohess tight --input command.inp  > xtb.out
wait # wait for all processes to finish before exit


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######### END XTB SUBMIT SCRIPT ########
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